制药工程专业依托微生物学河南省重点学科，作为“材料与化工”硕士专业学位培育点重要支撑专业，于2018年通过全国高校本科专业认证，2019年获批“国家级一流本科专业建设点”；近年来，与郑州大学、河南大学等多所高校联合培养硕士研究生30多名。
本专业现有专任教师28名，其中高级职称14人，联合培养硕士研究生导师8人；博士学位教师15人；柔性引进专家9人，其中院士2人，教育部“长江学者”特聘教授1人。享受国务院政府特殊津贴专家1人，河南省学术技术带头人1人，河南省文明教师3人，河南省教育厅学术技术带头人2人，河南省高校青年骨干教师2人。
本专业拥有河南省化工实验教学示范中心、河南省生物技术教学示范中心等4个省级教学示范中心；拥有3个校内综合实训实践基地：①煤制甲醇半实物化工仿真实训平台，为河南省示范性虚拟仿真实验教学立项建设项目；②制药工艺综合仿真实训平台；③曲克芦丁半合成类原料药及固体制剂实训基地；拥有12个专业实验室，教学仪器1500余台套，教学实验室总面积2000余m2，价值4000余万。
拥有与本专业相关的市级以上科研平台6个，拥有核磁共振波谱仪、高分辨质谱仪、X射线光电子能谱仪、透射电子显微镜等20余台套大型仪器。为培养学生的科研思维和创新能力提供了强有力的支撑。
产教融合、校企合作方面，该专业2006年以来，与华兰生物工程股份有限公司开展了联合培养人才，先后成立了3届订单班（2004年、2006年、2013年），共计116人，被光明日报报道，目前，许多毕业生已经成为企业骨干，受到企业的高度评价。先后对华兰生物工程股份有限公司、新乡拓新药业股份有限公司的员工多批以函授的形式，对企业员工进行学历教育，使企业数百名员工提升了学历层次，改善了员工的学历结构。和新乡拓新药业股份有限公司、河南绿园药业有限公司等企业联合开展科研攻关，在多种核苷及长春碱等合成工艺的优化中开展项目对接和技术指导，申请多项专利，参与2-氨基阿糖腺苷的制备、5-氮杂胞嘧啶的制备工艺等多项科技成果鉴定，为企业成果的项目申报和成果推广起到了一定的促进作用。依托这些项目，使学生的能力得到极大提升，许多学生在辉瑞、赛诺菲、上海恒瑞、华海药业、新和成等国内外知名企业就业。
本专业教师近5年主持及参与国家自然科学基金项目5项，获得河南省科技进步一等奖1项，新乡市科技进步一等奖1项，获得授权发明专利10项，获省级教育教学改革研究项目2项，主持省级科研项目10余项，主持市厅级科研项目20余项，校级精品课程5项。五年来，在国内外重要学术刊物上发表学术论文66篇，其中被国际三大检索（SCI, EI, ISTP）收录42篇，出版教材5部，部分章节摘用了本专业的科研成果。
